师兄是可以直接把自己心中的想法告诉药师佛，并且祈求他能够帮助自己完成心愿，师兄是可以这样说，祈求药师佛能够加持自己的父亲，让他能够身体健康，长命百岁，生活中也不会有烦心事出现。具体发愿的内容，师兄是可以根据自己心愿表达。

修行药师经的过程中，师兄首先就是要先去了解如何念药师经，以及在念诵的过程中有哪些注意事项，而且也不要有不恭敬药师佛的情况发生。

诵读药师经的注意事项:

1:首先在念药师经的时候，师兄是不可以在脏乱的地方诵读，因为这是对药师佛的不恭敬，同时在这种地方师兄也不能静心的去念诵。

2:在念诵药师经的过程中，师兄是可以发出声音的，大声小声都是可以的，因为在念诵出声音来的时候，师兄也可以自己去体会其中的含义。

3:在正式念诵药师经前，师兄是一定要先去洗手，并且漱口，这样是对药师佛的恭敬，同时也是对药师经的保护。

以上讲解的内容只是我个人的看法与体会，希望对师兄心中的疑问有所解答，如果有什么不好的地方，还要请师兄见谅。